MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012943	GTA	2	6	2885964	2885969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012943	GAC	2	6	2886049	2886054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_012943	GGT	2	6	2886058	2886063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012943	CGCA	2	8	2887116	2887123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_012943	GGTG	2	8	2887129	2887136	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012943	GAAT	2	8	2887152	2887159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012943	CCA	2	6	2887214	2887219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_012943	AAC	2	6	2887276	2887281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_012943	GCGCGT	2	12	2887330	2887341	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_012943	CG	3	6	2887354	2887359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_012943	GCG	2	6	2887444	2887449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_012943	GCA	2	6	2887465	2887470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_012943	GCT	2	6	2887499	2887504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_012943	GCA	2	6	2887515	2887520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_012943	TCC	2	6	2893589	2893594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_012943	TGCC	2	8	2893608	2893615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_012943	GGC	2	6	2893665	2893670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_012943	CAT	2	6	2893689	2893694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_012943	AGC	2	6	2893764	2893769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_012943	CGG	2	6	2894880	2894885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_012943	GGA	2	6	2894945	2894950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_012943	GGT	2	6	2894971	2894976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012943	CT	3	6	2899309	2899314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_012943	CGG	2	6	2899317	2899322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_012943	CCG	2	6	2899403	2899408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_012943	GCGG	2	8	2899537	2899544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_012943	TCA	2	6	2899607	2899612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_012943	CCTAA	2	10	2899701	2899710	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5029	NC_012943	CGT	2	6	2903415	2903420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_012943	CGCTC	2	10	2904785	2904794	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5031	NC_012943	TCG	2	6	2904799	2904804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_012943	GCC	2	6	2910752	2910757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_012943	TCT	2	6	2915179	2915184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012943	CGG	2	6	2915185	2915190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_012943	CCTTA	2	10	2917788	2917797	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5036	NC_012943	CCG	2	6	2917825	2917830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_012943	GGGT	2	8	2917865	2917872	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_012943	AAG	2	6	2917882	2917887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_012943	AC	3	6	2917889	2917894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_012943	TGA	2	6	2922259	2922264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012943	GGA	2	6	2922372	2922377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012943	GCC	2	6	2925294	2925299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_012943	CAG	2	6	2927042	2927047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_012943	GCC	2	6	2927057	2927062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_012943	GC	3	6	2928075	2928080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_012943	ACG	2	6	2928082	2928087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_012943	AC	3	6	2928109	2928114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_012943	ACA	2	6	2931463	2931468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_012943	GC	3	6	2931472	2931477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_012943	ACG	2	6	2933162	2933167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_012943	TTG	2	6	2933219	2933224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012943	CCCG	2	8	2935219	2935226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5053	NC_012943	ACC	2	6	2935307	2935312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_012943	CGG	2	6	2935338	2935343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_012943	ATC	2	6	2935373	2935378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_012943	GCC	2	6	2935439	2935444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_012943	TGG	2	6	2935467	2935472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_012943	G	6	6	2935471	2935476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012943	GTTT	2	8	2935518	2935525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012943	AGGG	2	8	2935544	2935551	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012943	TGT	2	6	2935552	2935557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_012943	G	6	6	2935637	2935642	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012943	CCA	2	6	2935650	2935655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_012943	CGTC	2	8	2935775	2935782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_012943	CG	4	8	2935825	2935832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_012943	ACG	2	6	2935856	2935861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5069	NC_012943	CAA	2	6	2936285	2936290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_012943	CG	3	6	2936404	2936409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_012943	ACC	2	6	2936541	2936546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5074	NC_012943	GT	4	8	2936860	2936867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012943	GCA	2	6	2936889	2936894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5077	NC_012943	ACT	2	6	2937040	2937045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_012943	GATC	2	8	2937097	2937104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_012943	GGT	2	6	2937113	2937118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_012943	CTGGC	2	10	2937231	2937240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5082	NC_012943	CGG	2	6	2937260	2937265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5085	NC_012943	CGG	2	6	2937406	2937411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_012943	GCT	2	6	2937486	2937491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_012943	CCT	2	6	2937502	2937507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_012943	CCG	2	6	2937609	2937614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_012943	TAG	2	6	2937670	2937675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_012943	CCT	2	6	2938039	2938044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_012943	AGG	2	6	2938057	2938062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_012943	CTCCC	2	10	2938104	2938113	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5096	NC_012943	GAG	2	6	2938163	2938168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_012943	CGG	2	6	2938192	2938197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_012943	GCT	2	6	2938222	2938227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5100	NC_012943	CA	4	8	2938380	2938387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_012943	TGCG	2	8	2938407	2938414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_012943	TCGC	2	8	2938433	2938440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_012943	ACT	2	6	2938442	2938447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_012943	TCC	2	6	2938469	2938474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_012943	TCCC	2	8	2938507	2938514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5106	NC_012943	TA	3	6	2938521	2938526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_012943	ACA	2	6	2938814	2938819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_012943	GT	3	6	2938857	2938862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012943	TGG	2	6	2938863	2938868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_012943	TGT	2	6	2938876	2938881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_012943	TGACG	2	10	2939097	2939106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5120	NC_012943	GT	3	6	2939111	2939116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_012943	TG	3	6	2939280	2939285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_012943	TC	3	6	2939354	2939359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_012943	CCA	2	6	2939368	2939373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_012943	CACGA	2	10	2939433	2939442	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5129	NC_012943	CA	3	6	2939468	2939473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5131	NC_012943	CCG	2	6	2939565	2939570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5260	NC_012943	CAG	2	6	3019173	3019178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_012943	AGA	2	6	3019214	3019219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_012943	GAG	2	6	3022955	3022960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_012943	CGA	2	6	3022972	3022977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_012943	AGGG	2	8	3023649	3023656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_012943	GC	3	6	3024509	3024514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_012943	GTT	2	6	3024521	3024526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_012943	GGC	2	6	3024568	3024573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5272	NC_012943	CGC	2	6	3030418	3030423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5274	NC_012943	C	6	6	3035335	3035340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5275	NC_012943	TATG	2	8	3038009	3038016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_012943	TTG	2	6	3041408	3041413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_012943	GCC	2	6	3046316	3046321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5295	NC_012943	GTT	2	6	3046322	3046327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5302	NC_012943	GCTG	2	8	3054550	3054557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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